党的十七大提出，加快建立以企业为主体、市场为导向、产学研相结合的技术创新体系。为此，应注重企业创新中的市场导向作用，并通过完善市场经济体制，建立企业创新的长效激励机制。

企业是市场经济最基本最活跃的细胞单元，是经济发展最重要的微观基础。市场机制主要通过企业发挥着对科技创新的导向作用。美国经济学家弗里德曼认为，市场价格具有三重作用：传递情报、提供刺激以及决定谁可以得到多少产品。企业根据市场价格情报，会产生基于市场产品需求的创新需求，进而对于相应要素产生需求。若企业由于创新冲动产生的要素需求能够获得满足，则创新行为就会得以实现。同时，一种新技术、新产品还要通过市场获得价格反馈，获悉人们对于此种创新的价格接受程度，以及此种创新是否可行等信息情报。根据这些情报，企业才能最终决定是否生产推广、怎样生产推广以及向谁生产推广。因此，市场价格机制是经济体中企业进行各种创新试验的最有效的工具。此外，市场价格还有一个重要作用，即决定谁可以得到什么资源和多少资源，以及谁可以得到什么产品和多少产品，也就是资源配置。党的十七大报告明确提出，引导和支持创新要素向企业集聚，促进科技成果向现实生产力转化。创新要素主要包含两方面的内容：一是创新的人力资本，二是创新的科技服务。人力资本与科技服务的产出主体是高等院校和科研院所。所以，当前引导和支持创新要素向企业集聚的关键之一，应是深化高等教育和科研机构的改革，使创新的人力资本要素和科技服务要素切实面向市场，对市场的价格信号充分敏感，自觉地根据动态比较优势和产业结构升级的要求调节人力资本要素和科技服务要素的供给。

企业的创新激励来自于预期的经济利润，而预期的经济利润又取决于三个变量，即预期收益、创新投资风险及其他机会成本。也可以用公式表示如下：预期经济利润＝预期收益的贴现－创新投资的风险－其他机会成本。企业永远要在当前消费与未来投资之间进行动态决策。预期收益越高越稳定，创新投资风险和其他机会成本越小，则企业的投资激励就越大，企业的创新投资主体地位才越会得到确立和加强。

主要有三个因素导致企业的创新激励不足。第一，当企业有现成的产业模式可供模仿时，组织及产业创新的机会成本加大，则创新激励就会减弱。目前，我国企业同质性问题比较突出，世界银行首席经济学家林毅夫称之为企业投资的“潮涌”现象，并评论说，发展中国家的产业处在世界产业链的内部，而且因为有发达国家的经验作为参考，所以在产业升级中，企业对哪个产业是新的有前景的产业很容易“英雄所见略同”，同时投向相同的产业，于是投资“潮涌”会像波浪一样，一波接一波出现。这一发展方式也被称为“模仿经济”或“后发优势”。而随着我国工业化程度的加深，新的优势还是要靠自主创新才能形成。第二，当企业对于未来预期收益不乐观时，创新投资激励便会下降。而企业的这种悲观主要与制度预期不稳定有关。随着专业化分工的加强，工业化经济向纵深发展，产业链条不断延长，短期性的相机制度行为越来越不利于形成企业稳定的制度预期，从而使企业不愿意开展专业化的技术创新，退而求其次，在企业内部追求大而全的产业链条。在企业看来，用大而全的产业链条形成的范围经济取代技术创新实现经济租金，可以有效规避因自主技术创新投入带来的未来收益不确定的风险。第三，创新本身的高风险性。企业以市场价格作为工具进行创新试验时会发现，有些创新是有效的，也有些创新是无效的，无效的创新甚至会直接导致企业破产。事实上，创新能力最强的美国同时也是公司破产率最高的国家。综上所述，在企业创新的高昂制度成本、机会成本以及创新的高风险合力作用下，企业的创新激励严重不足。因此，要充分发挥企业的创新主体作用，关键是要为企业的创新激励构筑强有力的制度保障，营造稳定的制度环境。

党的十七大提出，深化科技管理体制改革，优化科技资源配置，完善鼓励技术创新和科技成果产业化的法制保障、政策体系、激励机制、市场环境。在这个过程中，重要的原则是要建立企业创新的长效激励机制。这包括以法律形式规定平等物权的保护，用中长期的发展规划和宏观产业政策引导企业发展，以使企业形成稳定的政策预期。此外，要切实保障企业通过自主创新所带来的剩余索取权，完善知识产权及相关专利制度的立法，并提高执法水平。还应大力完善融资体系，特别是要大力培育和完善金融市场。改变企业以间接方式融资为主的局面，使企业的融资渠道多元化。通过充分发育的金融市场融资，不仅可以使金融资源在市场的指引下高效配置，还可以分担企业的投资风险。既然企业的自主创新不仅使企业本身受益，经济社会也会因自主创新实现整体收入和福利的普遍增长，那么，由社会来承担企业部分创新风险不仅在情理之中，而且也符合外部性内部化的经济规律。